VMD 是一款分子可视化程序，可使用三维图形和内置脚本显示、动画和分析大型生物分子系统。

PyMOL 是一款功能强大且全面的分子可视化软件，用于渲染和动画展示三维分子结构。

Vipster 是一款功能强大且用途广泛的周期性化学结构前处理和后处理工具。它从零开始设计，专为周期性模拟而打造。

探索至分子级别的详细三维细胞生物学，或游览生命的分子机器。CellWalk 是学生学习生物学的一种全新优美方式。