Gephi

Gephi
软件描述
Gephi 是用于各类图形和网络的领先可视化与探索软件。Gephi 是开源且免费的。
官方网站
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gephi.org
什么是 Gephi?
Gephi 是一款供数据分析师和科学家探索与理解图结构的工具。如同图形数据领域的 Photoshop™,用户可通过交互式操作图形表示,调整结构、形状和颜色,以揭示隐藏模式。其目标是帮助数据分析师提出假设,直观发现模式,识别数据采集过程中的结构性异常或故障。Gephi 作为传统统计分析的补充工具,因其可视化思维结合交互界面已被广泛认可为有助于推理。这是一款用于探索性数据分析(Exploratory Data Analysis)的软件,属于可视化分析研究领域的一种范式。
实时可视化
利用最快的图可视化引擎,加速对大规模图中模式的理解与发现。依托专用 OpenGL 引擎,Gephi 在网络交互式探索的效率与流畅性方面不断突破极限。
支持最多 10 万个节点和 100 万个边的网络
通过动态过滤迭代可视化
提供丰富的图形操作工具
布局
布局算法决定图的形态。Gephi 提供前沿的布局算法,在效率与质量上均表现优异。布局调色板允许用户在运行过程中实时调整布局参数,显著提升反馈速度与使用体验。
基于力的算法
优化图的可读性
度量
统计与度量框架提供了社会网络分析(SNA)及无标度网络中最常用的指标。
中介中心性、接近中心性、直径、聚类系数、PageRank
社区检测(模块度)
随机生成器
最短路径
随时间演化的网络
Gephi 在动态图分析领域处于创新前沿。用户可通过操控嵌入的时间轴,可视化网络随时间的演变过程。
导入采用 GEXF 文件格式的时序图
在时间维度上运行度量(如聚类系数)
支持图流处理
创建地图可视化
利用排序或分区数据使网络表达更具意义。自定义颜色、大小或标签,赋予网络表达明确含义。矢量预览模块可精细调整视觉效果,确保导出 SVG 或 PDF 前达到最佳美学效果。
支持可定制的 PDF、SVG 和 PNG 导出
保存配置预设
动态过滤
根据网络结构或数据对网络进行筛选,选择特定节点和/或边。通过交互式界面实现实时过滤。
无需编写脚本即可构建复杂过滤查询
从过滤结果中创建新网络
保存常用查询
数据表与编辑
Gephi 自带数据实验室,提供类似 Excel 的界面,用于操作数据列、搜索与转换数据。
强大的查找/替换功能
列操作
批量编辑、自定义列合并等
🔄 替代方案
48 个选择yEd 是一款功能强大的图表编辑器,可用于快速手动创建图表,或导入外部数据进行分析,并通过一键操作自动排列大型数据集。您可使用 yEd 快速创建流程图、BPMN 和 UML 图表……
PlantUML 是一个开源工具,使用简单的文本描述来绘制 UML 图。该生成器可在任何 JVM 环境中运行,并可与各种应用(如维基、文本编辑器、IDE、编程语言、文档生成器等)集成。

quiver diagram editor
高效基于网页的工具,用于构建高质量交换图。支持带嵌入链接的LaTeX导出,提供直观界面,兼容鼠标和键盘输入,并具备多选、宏支持和智能标签对齐等功能。
OmniGraffle 可通过提供强大的样式工具、保持线条与形状的连接性(即使移动后仍保持连接),以及一键自动整理图表,帮助您快速制作出引人注目的图形文档。

Graphviz
Graphviz 是一款开源的图形可视化软件。图形可视化是一种以抽象图和网络的图表形式表示结构信息的方法。它在网络技术、生物信息学、软件工程、数据库和网页设计等领域具有重要应用。

Tableau
Tableau 帮助世界上最大的组织释放其最宝贵资产——数据和人才——的潜力。

Cytoscape
Cytoscape 是一个开源软件平台,用于可视化复杂网络并将其与各种属性数据进行整合。它提供了大量插件,适用于生物信息学、社交网络分析和语义网等多种应用领域。





