Cytoscape
Cytoscape
软件
软件描述
Cytoscape 是一个开源软件平台，用于可视化复杂网络并将其与各种属性数据进行整合。它提供了大量插件，适用于生物信息学、社交网络分析和语义网等多种应用领域。
官方网站
访问软件的官方网站了解更多信息
www.cytoscape.org
什么是 Cytoscape?
Cytoscape 是一个开源软件平台，用于可视化复杂网络并将其与各类属性数据整合。它提供了大量适用于不同问题领域的插件，包括生物信息学、社交网络分析和语义网。
Cytoscape 支持分子生物学和系统生物学、基因组学及蛋白质组学中的多种应用场景：
以多种格式加载分子和遗传相互作用数据集
投影并整合全局数据集和功能注释
在这些数据之间建立强大的可视化映射
利用 Cytoscape 插件执行高级分析和建模
可视化和分析人工整理的通路数据集，如 Reactome 或 KEGG。
🔄 替代方案
17 个选择
Linkurious
Linkurious 提供一个用于欺诈检测、反洗钱、情报分析或网络安全的图可视化与分析平台。该平台易于部署且高度可扩展，使用户能够轻松发现复杂关联数据中隐藏的洞察。
ikolinks
探索精选内容、实用资源和精彩更新。立即注册，了解更多信息。一个平台，畅享所有功能。
Gephi
Gephi 是用于各类图形和网络的领先可视化与探索软件。Gephi 是开源且免费的。
Graphia
Graphia 是一款功能强大的开源可视化分析应用程序，旨在帮助解读大型复杂数据集。
NodeXL
NodeXL 是一款免费的开源模板，适用于 Microsoft® Excel® 2007 和 2010，可轻松探索网络图。使用 NodeXL，您可以在工作表中输入网络边列表，点击按钮即可查看图表，所有操作均在熟悉的 Excel 环境中完成。
Tabnetviz
基于表格的网络可视化工具，一个从节点表和边表生成静态网络图的命令行工具。
Wandora.org
Wandora 是一个基于主题图和 Java 的通用信息提取、管理和发布应用程序。Wandora 具有图形用户界面、分层合并的信息模型、多种可视化模型以及庞大的信息提取和导入功能集合。