Cytoscape 是一个开源软件平台，用于可视化复杂网络并将其与各种属性数据进行整合。它提供了大量插件，适用于生物信息学、社交网络分析和语义网等多种应用领域。

提供 17 个替代方案

基于表格的网络可视化工具，一个从节点表和边表生成静态网络图的命令行工具。

提供 6 个替代方案

Mendelgen 是一款在线 DNA 载体编辑与操作工具，提供多序列比对、密码子优化、功能元件检测等功能。其界面设计精美且直观，让您的使用体验轻松愉悦。

提供 29 个替代方案

AliView 是另一款比对查看和编辑工具，但可能是最快捷、最直观易用的，不会过于臃肿，希望你会喜欢。

提供 4 个替代方案

UGENE 是免费的开源跨平台生物信息学软件。

提供 25 个替代方案

Eterna是一款公民科学游戏，玩家通过解谜学习设计用于医学研究的RNA分子。完成这些谜题即可解锁实验室权限，并参与挑战，发明新药！

提供 5 个替代方案

尽管看起来只是一款游戏，Phylo 实际上是一个利用人类计算能力解决共同问题——多重序列比对的框架。

提供 10 个替代方案

Genophore 是一款用于搜索和设计蛋白质的应用程序，同时还提供一系列生物信息学工具和协作工具。

提供 27 个替代方案

Clustal Omega 是一个多重序列比对程序。它能够生成具有生物学意义的差异序列多重序列比对结果。通过查看分支图或系统发育图，可以观察到进化关系。

DNA Baser序列组装软件是一款革命性的生物信息学软件，用于手动和自动DNA序列组装、DNA序列分析、重叠群编辑、文件格式转换及突变检测。

Pathomx 是一款基于工作流的实验数据分析与可视化工具。最初作为代谢组学数据分析工具开发，现已扩展，可用于任何科学及非科学数据的分析。

功能全面的生物信息学工具包，适用于多种基因组分析需求，包括转录组学、变异检测、表观基因组学、宏基因组学、比较基因组学等。

Kineviz GraphXR 是一个基于浏览器的可视化平台，用于对大规模、高维度或关联数据进行交互式分析。

Graphia 是一款功能强大的开源可视化分析应用程序，旨在帮助解读大型复杂数据集。

BioSciTools（生物信息学科学工具）是一款基于Java 11开发的桌面程序，旨在为生物信息学的发展带来新的探索与贡献，并实现序列分析、多组学等领域的数据分析与可视化。

Snthesis Bio 平台可自动整合并统一您的所有研究数据。兼容任何数据源。全面搜索。

DNAssist 提供了一个直观的单一界面，用于显示、编辑和分析序列文件。用户可通过选择字体、字体大小和行长度来自定义编辑窗口的显示。

Clone Manager 是 Sci-Ed 公司开发的一款商业生物信息学软件套件，可帮助分子生物学家进行数据管理，并执行某些计算机预分析。

工作台用的DNA分析。

QIAGEN CLC Main Workbench 适用于DNA、RNA及蛋白质序列数据分析，功能丰富多样，无需高级计算机技能！该工作台支持Windows、Mac OS X和Linux平台。