UGENE

RasMol 是一款用于分子图形可视化、主要针对蛋白质数据银行中生物大分子结构的描绘与探索而设计和使用的计算机程序。

AliView 是另一款比对查看和编辑工具，但可能是最快捷、最直观易用的，不会过于臃肿，希望你会喜欢。

BioEdit 是为 Windows 95/98/NT/2000/XP/7 编写的生物序列比对编辑器。直观的多文档界面及便捷功能，使在台式计算机上进行序列的比对和操作变得相对简单。

Genophore 是一款用于搜索和设计蛋白质的应用程序，同时还提供一系列生物信息学工具和协作工具。

Technelysium 提供两款软件应用程序：Chromas 和 ChromasPro。

Geneious 将所有主要的DNA和蛋白质序列分析工具整合到一款革命性的软件解决方案中！

Ridom TraceEdit 是一款跨平台的图形化DNA测序图查看和编辑工具。TraceEdit 可显示来自应用生物系统自动测序仪的色谱图文件以及 Staden SCF 格式的文件。

适用于苹果Macintosh和Windows的树形图绘制软件。