Rasmol

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RasMol 是一个用于分子图形可视化计算机程序,主要目的是描绘和探索生物大分子结构,如蛋白质数据银行中所包含的结构。
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什么是 Rasmol?
RasMol 是一个用于分子图形可视化计算机程序,主要应用于生物大分子结构(如蛋白质数据银行中的结构)的展示和探索。该程序最初由罗杰·赛尔(Roger Sayle)于20世纪90年代初开发。历史上,它曾是分子生物学家的重要工具,因为其高度优化的程序能够在当时性能尚可的个人电脑上运行。在RasMol出现之前,可视化软件只能在图形工作站上运行,而这类设备因价格昂贵,难以被学者们获取。如今,RasMol不仅成为重要的教学工具,也仍然是结构生物学研究中的重要工具。RasMol的版本历史较为复杂,从2.7系列版本开始,它采用双许可模式(即GPL许可或自定义许可RASLIC)。RasMol包含一种脚本语言(可用于选择特定的蛋白质链、更改颜色等)。Jmol和Sirius已将RasMol的脚本语言整合到其命令中。蛋白质数据银行(PDB)文件可从全球蛋白质数据银行(wwPDB)成员处下载以供可视化使用。这些文件由研究者上传,他们通常通过X射线晶体学、核磁共振(NMR)或电子显微镜等方法对分子结构进行表征。