Mendelgen 是一款在线 DNA 载体编辑与操作工具，提供多序列比对、密码子优化、功能元件检测等功能。其界面设计精美且直观，让您的使用体验轻松愉悦。

提供 29 个替代方案

DNADynamo - 适用于 Windows、OSX 和 Linux。立即下载，实现 ABI/SCF 测序片段对齐、亚克隆与质粒管理、BLAST/序列检索、序列注释及结构查看等功能，所有功能集成于一个易于使用的生物信息学软件中。

提供 26 个替代方案

AliView 是另一款比对查看和编辑工具，但可能是最快捷、最直观易用的，不会过于臃肿，希望你会喜欢。

提供 4 个替代方案

UGENE 是免费的开源跨平台生物信息学软件。

提供 25 个替代方案

GENtle 是一款用于 DNA 和氨基酸编辑、数据库管理、质粒图谱、限制性酶切与连接、序列比对、测序数据导入、计算器、凝胶图像显示、PCR 等功能的软件。

BioEdit 是为 Windows 95/98/NT/2000/XP/7 编写的生物序列比对编辑器。直观的多文档界面及便捷功能，使在台式计算机上进行序列的比对和操作变得相对简单。

提供 28 个替代方案

Clustal Omega 是一个多重序列比对程序。它能够生成具有生物学意义的差异序列多重序列比对结果。通过查看分支图或系统发育图，可以观察到进化关系。

多序列比对软件。

DNA Baser序列组装软件是一款革命性的生物信息学软件，用于手动和自动DNA序列组装、DNA序列分析、重叠群编辑、文件格式转换及突变检测。

MacVector 是一款功能全面的 Macintosh 应用程序，提供序列编辑、引物设计、克隆与构建设计、互联网数据库搜索、蛋白质分析、序列验证、多序列比对、系统发育重建、编码区等功能。

4Peaks - 为峰而生，四峰。屡获殊荣的4Peaks帮助分子生物学家可视化和编辑其DNA序列测序文件。分析您的序列从未如此有趣！

Geneious 将所有主要的DNA和蛋白质序列分析工具整合到一款革命性的软件解决方案中！

Boxshade 是一个用于从多个蛋白质或DNA序列的比对中生成美观打印输出的程序。该程序本身不进行比对，而是接收由多序列比对程序或多序列编辑器（如 ClustalOmega）预处理后的文件作为输入。

DNAssist 提供了一个直观的单一界面，用于显示、编辑和分析序列文件。用户可通过选择字体、字体大小和行长度来自定义编辑窗口的显示。

Clone Manager 是 Sci-Ed 公司开发的一款商业生物信息学软件套件，可帮助分子生物学家进行数据管理，并执行某些计算机预分析。

GeneStudio Pro 是一款基于序列格式转换引擎 SeqVerter 构建的现代分子生物学应用程序套件，适用于 Windows 平台。因此，用户在处理不同格式的序列时，操作无缝且透明。