Cytoscape

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软件

软件描述

Cytoscape 是一个开源软件平台,用于可视化复杂网络并将其与各种属性数据进行整合。它提供了大量插件,适用于生物信息学、社交网络分析和语义网等多种应用领域。

官方网站

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官方认证

www.cytoscape.org

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什么是 Cytoscape?

Cytoscape 是一个开源软件平台,用于可视化复杂网络并将其与各类属性数据整合。它提供了大量适用于不同问题领域的插件,包括生物信息学、社交网络分析和语义网。

Cytoscape 支持分子生物学和系统生物学、基因组学及蛋白质组学中的多种应用场景: 以多种格式加载分子和遗传相互作用数据集
投影并整合全局数据集和功能注释
在这些数据之间建立强大的可视化映射
利用 Cytoscape 插件执行高级分析和建模
可视化和分析人工整理的通路数据集,如 Reactome 或 KEGG。

🔄 替代方案

17 个选择

Kenelyze 是一个可视化分析平台,任何人都可以使用任何数据集即时创建完全交互式的网络地图。

付费 • 专有
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Polinode 是一款便于进行强大网络分析的工具。您可以上传自己的网络数据,或使用内置的关系调查工具收集数据,然后对其进行分析和可视化。

付费 • 专有
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Neoclipse 是一个独立的工作台应用程序,用于与 Neo4j(数据库目录或服务器)交互。它支持 Cypher、索引搜索、可视化和图更新。

免费 • 开源
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TextQuery

TextQuery

软件

TextQuery 是一款桌面应用程序,可让您导入数据文件作为表格,使用 SQL 查询数据,并基于查询结果创建精美的图表。

免费增值 • 专有
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KeyLines Graph Visualization Toolkit

KeyLines Graph Visualization Toolkit

图表编辑器, 社交媒体分析

KeyLines 是一个 JavaScript 工具包,供开发者快速构建强大的网络可视化应用。

付费 • 专有
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Kineviz GraphXR 是一个基于浏览器的可视化平台,用于对大规模、高维度或关联数据进行交互式分析。

免费个人 • 专有
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Touchgraph Navigator

Touchgraph Navigator

软件

TouchGraph 是数据可视化软件 TouchGraph Navigator 2 的开发商。通过 TouchGraph Navigator 2,用户可上传数据并创建“交互式网络图”。用户可购买 TouchGraph Navigator 桌面版或其他版本的许可证……

付费 • 专有
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Pathomx

Pathomx

软件

Pathomx 是一款基于工作流的实验数据分析与可视化工具。最初作为代谢组学数据分析工具开发,现已扩展,可用于任何科学及非科学数据的分析。

免费 • 开源
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