Cytoscape
Cytoscape
软件
软件描述
Cytoscape 是一个开源软件平台，用于可视化复杂网络并将其与各种属性数据进行整合。它提供了大量插件，适用于生物信息学、社交网络分析和语义网等多种应用领域。
官方网站
访问软件的官方网站了解更多信息
www.cytoscape.org
什么是 Cytoscape?
Cytoscape 是一个开源软件平台，用于可视化复杂网络并将其与各类属性数据整合。它提供了大量适用于不同问题领域的插件，包括生物信息学、社交网络分析和语义网。
Cytoscape 支持分子生物学和系统生物学、基因组学及蛋白质组学中的多种应用场景：
以多种格式加载分子和遗传相互作用数据集
投影并整合全局数据集和功能注释
在这些数据之间建立强大的可视化映射
利用 Cytoscape 插件执行高级分析和建模
可视化和分析人工整理的通路数据集，如 Reactome 或 KEGG。
🔄 替代方案
17 个选择
Polinode
Polinode 是一款便于进行强大网络分析的工具。您可以上传自己的网络数据，或使用内置的关系调查工具收集数据，然后对其进行分析和可视化。
Neoclipse
Neoclipse 是一个独立的工作台应用程序，用于与 Neo4j（数据库目录或服务器）交互。它支持 Cypher、索引搜索、可视化和图更新。
TextQuery
TextQuery 是一款桌面应用程序，可让您导入数据文件作为表格，使用 SQL 查询数据，并基于查询结果创建精美的图表。
Touchgraph Navigator
TouchGraph 是数据可视化软件 TouchGraph Navigator 2 的开发商。通过 TouchGraph Navigator 2，用户可上传数据并创建“交互式网络图”。用户可购买 TouchGraph Navigator 桌面版或其他版本的许可证……
Pathomx
Pathomx 是一款基于工作流的实验数据分析与可视化工具。最初作为代谢组学数据分析工具开发，现已扩展，可用于任何科学及非科学数据的分析。